Öncelikle, halihazırda modladığınız halde aldığınız kayıt dosyasında mı bu hata gerçekleşiyor ? Mutlaka donanımsal veya yazılımsal olmak zorunda değil çünkü sebebi. Belki direkt oyun içi dosyalardan birisi zarar görmüş olabilir.
Bir de oyununuz orijinal mi ? Eğer değilse, modlar çok çabuk bozabiliyor Bethesda oyunlarını. Orijinal ise, her türlü modu silip, Steam'den dosya doğrulama işlemi gerçekleştirmeyi deneyebilirsiniz.
Yeni bir oyuna başlayıp denemenizde de fayda var. Doğrudan mevcut save dosya(ları)nız da zarar görmüş olabilir.
Eğer böyle değilse, kulağa garip gelecek biliyorum ama oyunu windowed-fullscreen moduna alıp oynamayı dener misiniz ? Bazı Bethesda oyunları, özellikle de Fallout 3 - New Vegas, Skyrim gibi 7-8-9 senelik oyunlar, 60FPS'i aştığı zaman, V-SYNC kapalı olduğu zaman bu tip sorunlar yaratabiliyor. Bu tip oyunlarda FPS = 60 olduğu zaman da görsel anlamda bir kayıp yaşanmayacağı için çok problem olmaz diye düşünüyorum.
Aynısı benim de Skyrim'de başıma gelmişti. Bu şekilde çözmüştüm. Normalde ekranım 180Hz olmasına karşın, uygulama harici boşta masaüstünde iken, 60Hz'ye ayarlı. Oyun 180 Hz'yi görünce haliyle sapıtmıştı. Her han-kale vs giriş çıkışında kapanıyordu.
Mümkünse V-Sync açıp, ekranınızın ayarı varsa, boşta 60Hz olacak şekilde ayarlayıp deneyebilirsiniz. Bu sayede windowed-fullscreen oyunlarınız 60 FPS'e sabitlenecektir. En azından eski sayılabilecek oyunlar için sorunların çözümünde iş görebilir.
Bu doğrudan kesin bir çözüm değil ama umarım böyle basit bir iki hamle ile giderilir sorununuz.