Linux çalıştırma sistemiyle Win çalıştırma sistemi farlı olduğu için birbirleri arasında özel tasarlanmış zararlıları çalıştıramazsınız zaten. Ancak dosya türlerine ve sızma girişimlerine göre tabi artan bir zararlı artışı mevcut o yüzden hangi OS kullanıyorsanız o OS için AV güvenliği sağlarsanız sorun yaşamazsınız.
Linux için güncellemeleri aldığınız sürece, güvenli yerlerde geziyorsanız sorun yaşamazsınız. Linux için kişisel bilgisayarlarda desteklenen çok fazla AV bulunmuyor endpoint çözümleri var bunlar genelde şirket ve serverlarla ilgili olduğu için standart kullanıcılar için gereksiz.
Windows geçiş yapacaksaınız dediğim gibi orada güvenlik çözümlerini kullanıp tarama yapabilirisniz geçrdiğiniz dosyaları.