Windows kurulumunda C'yi biçimlendirmek

Bilgisayarımı bugün açtım, masaüstü komple gitmişti, hiçbir dosya kalmamıştı. Ve arkadaşımın kurduğu setup'lar benim bilgisayarımda kurulmuyordu. Biz Autocad kullanıyoruz mesela arkadaşım aynı setup dosyasıyla kurabilirken ben o setup dosyasıyla kurmaya çalıştığımda yarısında hata veriyor veya programı eksik kuruyor. Büyük ihtimalle virüs bulaştığını düşünüyorum. USB ile sadece C'ye format atmaya çalıştım ama beceremedim. Sadece Windows'u yeniden yüklemiş olduğumu fark ettim. Yurt dışında yaşadığım için formata abuk subuk fiyatlar istiyorlar ve açıkçası bu parayı vermek istemiyorum. C'de sadece Windows ve sistem dosyaları kalsın geri kalan dışardan yüklenen her şey silinsin istiyorum. Bunu nasıl yapabilirim? Önerisi olan arkadaşlar yardımcı olursa sevinirim.