Son kullanma tarihi geçmiş, bayatlamış bir tarayıcı kullanıyorsanız, Mercedes kullanmak yerine tosbağaya binmek gibi... Web sitelerini düzgün görüntüleyemiyorsanız eh, bi' zahmet tarayıcınızı güncelleyiniz. Modern Web standartlarını karşılayan bir tarayıcı alternatifine göz atın.
SQL ifadeleri her yerde aynıdır sadece arayüz farkı olacaktır. Ancak dediğim gibi phpMyAdmin kullanmaya alıştıysanız diğerini öğrenmekle vakit kaybetmeyin. WampServer kurarak rahatlıkla işinizi görebilirsiniz. WampServer kurulumu ile ilgili bir sürü kaynak video bulabileceğinize eminim.
Çok fazla bir eksisi olmaz. Linux daha hafif bir işletim sistemi olduğu için daha çok tercih ediliyor. Ancak benim söylemek istediğim zaten Windows Server'ın kendi veritabanı yönetim sistemi olmasından dolayı MySQL ve phpMyAdmin'e gerek olmadığıydı. Sen onları kullanmayı biliyorsan veya onlara...
Windows serverda bunları kullanmak ne kadar mantıklı bilemiyorum ancak Youtube'da bununla ilgili videolar var. Ya da WampServer yazılımını kurarak zaten kendi içerisinde gelen phpMyAdmin ve MySQL'i kullanabilirsin.