Nacizane önerilerim:
1) klonlama yapabilirsiniz, bir zararı olmaz. CloneZilla ile kolayca HDD'yi SSD'ye aktarabilirsiniz.
2) Bağlanma sıraları önemli değildir. Önemli olan anakartın ikisini de doğru görmesi. Yazılımsal olarak hangisinin öncelikli olduğunu siz, Windows'u kurarken...