Bu çok alınan bir hata eğer Ubuntu'da yanına kur seçeneğini işaretlerseniz GRUB Windows Bootloader'ın üzerine kurulur. Düzeltilmesi için galiba Windows Bootloader'ın tekrar kurulması gerekiyor diye biliyorum. HDD değiştirirseniz sorun çözülür evet, ayrıca HDD değil SSD almanızı öneririm.