Hocam İngilizcem çok iyi değildir ama anladığım kadarıyla anlatmaya çalışayım.
Are çoğul ve ikinci tekil şahıs.
Is tekil
Are; you, we, they.
Is; he, she, it.
Am; I.
You are perfect cümlesi hatasız ama ikinci cümle hatalı ama hatasızmış gibi kullanabilirsin yani you is perfect dersen eğer, sen mükemmelliksin/mükemmellin tanımısın gibi bir anlam çıkarılabilir ama karşı tarafın anlayıp anlamaması riskine girmeye değmez bence.
What are you doing cümlesinde bir sorun yok ama What is you doing cümlesi şu anlamda kullanılabilir; şu anda bulunduğun durum nedir/ ya da Türkçedeki gibi "ne yaptın" cümlesi gibi. Halbuki o anda yapıyor ama geçmiş zamanda kullanıyoruz. Bu tarz cümleler anlamsız ve hatalı gibi görünse de aslında duygusal olarak bir anlam aramak gerekiyor.
Were ve was geçmiş zaman.
Were; you, we, they. ( When they were children bla bla... )
Was; I, he, she, it için kullanılır. ( When i was a child bla bla... )
Has ve have sahiplik bildirir ya da duruma göre zorunluluk. (Have to, has to)
Have; you, we, they, I. ( I have a dog ), ( I have to clean my room )
Has; he, she, it ( She have a cat ), (She has to clean her room. )