Anakartın performansa etkisi çok düşük zaten. Form faktörünün değişimi port sayısını vs. değiştirir. ATX anakartlı sistem mATX anakartlı sistemden kesinlikle daha fazla FPS verir diye bir şey yok.
Fakat sistem toplarkenki tek hedefiniz performans olmamalı. Uzun ömürlülük, dayanıklılık, güvenilirlik gibi etkenleri de göz önünde bulundurmalısınız.