Windows üzerinden kendi dosyaları ile format atarsanız gitmez fakat virüs format dosyalarına bulaşmışta olabilir. Sonuç olarak temiz format daha iyi olur.
Hocam şimdi sizin sorunuz öncelikli olduğu için cevap vereyim Windows'u ayarlardan sıfırlarsanız Windows gitmez sadece dosyalar gider yine de biz size temiz Windows kurulumu yapmanızı öneririz temiz kurulum: USB flash disk ile Windows kurulumu.
Hocam sıfırlama işlemi sistemde sürücü sorunlarına ve sistemde çeşitli sorunlara sebep olabiliyor. Ayrıca bu işlemin süresi normal temiz kurulum süresinden kat ve kat daha uzun sürüyor. O yüzden önermiyorum.
Asıl soruya gelirsek;
Sıfırlama işleminde Windows ya da diskleriniz gitmez, Windows yeniden kurulur.