Klonlamada direkt olarak diskin tamamı kopyalanmak zorunda değil. Sadece sistemin yüklü olduğu C sürücüsü de aktarılabilir. Seçim sizindir. C sürücüsünden sadece Windows'u alayım, diğer programlar kalsın diye bir şey yok maalesef. Eğer öyle olmasını istiyorsanız SSD'ye temiz kurulum gereklidir.
İkinci diske de ayrıca Windows kurulduktan sonra, artık iki diskte de bootloader programı olacağı için anakart öncelik sırasına göre hangi disk üstteyse ondan çalıştırır. Yani siz SSD'ye kurulum yaptıktan sonra HDD'yi taktığınızda BIOS üzerinde iki adet Windows önyükleyici gözükür. Orada SSD olanı seçtiğinizde sistem artık oradan başlar. Daha sonra dilerseniz HDD'yi biçimlendirebilirsiniz.