Herhangi bir karışıklık olmuyor. Windows'u görmeme gibi bir durum olursa da EFI'sinden gerekli dosyatı /boot/efi içine aktarıyorsun oluyor bitiyor ki GRUB görüyor ekstrem bir durum oluşmazsa.
Hocam emin olun sizin silme ihtimaliniz daha yüksek. Windows'un yanına kur dediğiniz zaman zaten Windows'un ve onun efisinin dışındaki yerleri hedefliyor.
Windows'u görmeme gibi bir durum olursa da EFI'sinden gerekli dosyatı /boot/efi içine aktarıyorsun oluyor bitiyor ki GRUB görüyor ekstrem bir durum oluşmazsa.
Hocam Windows'un yanına kur seçeneği Windows'u silmez. Defalarca kez öyle kurulum yaptım. Birinde bile sorun yaşamadım. Elle kurulum boşu boşuna uğraştığınız bir süreç.