Kernel çekirdek demektir. Linux ta bulunur. Androidte de vardır. Kernel yüklemek cihazı garanti dışı bırakır. Her kernel her andoid sürümüne uymaz. Kernel ile çok şey yapılabilir. Örneğin: cpu OC yapmak (Live OC destekliyse gpu ram bus gibi hepsi OC olabilir.) Mesela ilk çıkan galaxy s ile OC yapınca yüksek ayarlarda kasmadan asphalt 8 oynanabiliyor. Takas dosyası oluşturulabiliyor. Farklı dosya sistemleri desteklenebiliyor.
Sistem ayar dosyası (built.prop) tweakleri systwcl tweakleri yapılabiliyor. Tabii bunlar kernel destekli olması lazım birde root yetkisi