Tabii ki kullanabilirsiniz. M.2 SSD'yi M.2 yuvasına, diğer SSD'yi SATA portlarından birisine takacaksınız. Hangisinin kullanıldığını nasıl bileceğim derken ne demek istediğinizi anlamadım ama Windows'u hangisinin içine kurarsanız oradan çalışır. Diğer disk de normal depolama diski olarak görünecektir.