GPT yeni nesil için biçilmiş kaftan. Ayrıca UEFI desteği de iyi. Tavsiyem GPT'dir, fakat normalde Windows kurulmuş diskiniz varsa onun disk bölümleme biçimini öğrenip ona göre yapmanız gerektiği taraftarıyım.
UEFI ise geçmesi mi gerek? MBR ile de UEFI kullanılıyor bir kere. UEFI'yi daha çok destekleyen GPT, Legacy'i destekleyen MBR'dir.