Liste elemanı olan li etiketinin içerisinde ul etiketini kullandıysanız tarayıcı otomatik olarak içerideki etikete padding tanımlayacaktır. Tarayıcıya bunu yapmaması gerektiğini söylemeniz gerekiyor. Kısaca menünün alt elemanı olan ul etiketine padding:0 özelliğini tanımlamalısınız.