Şu an güncel Windows sürümlerinde bulunan NT çekirdeği ile MS-DOS çekirdeği o kadar farklı ki, güncel programların uyumluluğu açısından bahsettiğiniz durumun imkanı yok.
MS DOS olması için mantıklı bir sebep yok. İllaki çekirdek değişikliği olacaksa MS DOS'u 64 bite portlamak yerine sıfırdan kernel yazarlar ama ikisi de şu anlık gerçekleşmesi imkânsız görünüyor.