Bugün aynı sorunu bende yaşadım ve çözümünü şu şekilde hallettim:
AppData -> Roaming -> Opera Software -> Opera Stable içindeki bütün dosyaları kopyaladım ve aynı "Opera Software" konumunda ki Opera GX içinde ki dosyaları silip, kopyaladığım dosyaları da bu klasöre attım. Yaptığım işlem ne kadar doğru bilmem ama ben de bütün giriş yaptığım kayıtlı hesapların hepsi Opera GX'e geçti.