Bölümlere ayırırsanız windows sisteminiz ayrı disk olarak diğer diskiniz ayrı olarak görünür program yükleme konusunda sıkıntı olmaz. Tavsiyem 2. SSD bellek alarak onun içine oyun müzik dosya v.b şeyleri yükleyebilirisiniz ya da elinizde SSD'nin belleği yetiyorsa 2. SSD'ye gerek kalmaz.
Tabii ki yükleyebilirsiniz. Zaten SSD'niz 120-250 GB ise bölümlere ayırmanıza gerek yok. Tek bir C: olarak kullanın. D: bölümü içinse farklı bir HDD kullansanız da olur.