Freedos bilgisayarlar genelde başta bir önyükleyici olmadığı için otomatik USB'den kurulum başlatır, veya açılırken boot cihazı seçme ekranı kısayolu olur (anakarta göre değişen). Kurulum bitince, Windows giriş dil seçme ekranı gelince USB'yi çıkartabirsiniz.
BIOS'dan USB'yi boot olarak en başa koyarsanız USB takılı olduğu sürece tekrar kurulum açılacaktır.