Windows 10'da dosyanın içine yüklenen uygulamalar nasıl engellenir?

Selamlar Windows 10'da bazı dosyaların içinden sildiğim bir şeyler oluyor bunlar tekrardan bir süre sonra Windows güncellemesi veya uygulamanın kendi güncellemesini aldığı zaman içindeki o sildiğim işe yaramayan bir dosya uygulama tekrar yüklenmiş oluyor. Bunu nasıl engelleyebilirim kod mu yazmalıyım veya herhangi başka bir şey mi?