Sorun olmaz. GRUB Bootloader kuracaktır açılışta seçiminizi buradan yapabilirsiniz ancak Kali Linux'u silerseniz Windows için ayrı bir ayar çekmeniz gerakecek. (Bende öyle oldu )
Kurulumu yaptım sonucunda GRUB loader Windows 8.1'i okumadı sadece Linux açıldı Windows kurulumunda Harddiski başka bir bilgisayara takarak NTFS olarak biçimlendirip tekrar Windows 8.1 kurdum.