Sadece sistem dosyası olmayabilir, diğer programlara ait dosyalar da bulunabilir Windows dizininde fakat yine de sistem dosyaları da aralarında varsa diye
@Xevanior dediği gibi
SFC /scannow ile onarım yapmayı deneyebilirsin. Zararı yoktur, aksine faydası olan bir işlemdir.