Konuyla ilgili kapsamlı bir makalemiz gelecek ama kısaca özetleyeyim: Wordpress'in ilk sürümleri veritabanı türü olarak MyISAM kullanıyordu. Fakat yeni çıkan sürümlerle birlikte InnoDB'ye geçildi. Lakin Wordpress güncellemesi esnasında bu geçiş gerçeleşmediğinden veritabanını elle dönüştürmeniz gerekiyor. Bunu phpMyAdmin içinden yapabilirsiniz.
Ya da bir Wordpress eklentisi de bu işi yapabiliyor:
Easily configure automatic updates from the admin interface and modernize your MySQL database.
wordpress.org
Eklentiyi kurduktan sonra Araçlar altından MyISAM'dan InnoDB'ye dönüştürme seçeneğini bulabilirsiniz. Veritabanı boyutuna göre bu işlem saatler sürebilir!
Uyarı! MySQL 5.5 ve üstü kullandığınızdan emin olun zira FULL TEXT indeks desteği bu sürümle geldi.