Toyota Yaris hybrid'in motorlu taşıtlar vergisi geleneksel benzinli ve dizel araçlarda da olduğu gibi aracın yaşı ve motor silindir hacmine göre belirlenmektedir. Yaris hybrid her sene 2 eşit taksitte ödenen motorlu taşıtlar vergisi haricinde ekstra bir vergiye tabi değildir.