Birbirine yakın olsa da farklı uzmanlıklar içerir.
Bilgisayar mühendisliği, hem donanım hem yazılım alanında bilgi sahibi olmayı gerektirir. Bir bilgisayarın işlemcisi nasıl çalışır, bellek yapıları nasıldır, gömülü sistemler nasıl tasarlanır gibi konular bilgisayar mühendislerinin ilgi alanına girer. Temelinde elektronik mühendisliği ve bilgisayar bilimi birleşir.
Öte yandan yazılım mühendisliği, sadece yazılım üretim süreçlerine odaklanır. Bir uygulama nasıl planlanır, tasarlanır, test edilir ve sürdürülebilir hale getirilir gibi sorulara cevap arar. Amaç, güvenilir, verimli ve kullanıcı dostu yazılımlar üretmektir.
Kısaca söylemek gerekirse; bilgisayar mühendisi, bilgisayarın nasıl çalıştığını anlamaya odaklanır, yazılım mühendisi ise o bilgisayarda nelerin çalıştığını planlar ve inşa eder. Her iki meslek de teknolojinin bel kemiğidir, ama yol ayrımları nettir.