Aynı sıkıntı ile karşılaştım. İşlemi sonlandırdıktan sonra tekrar çalıştırdığınızda açılması gerekiyor. Comodo ürünleri biraz böyle, kod kalitesinin pek iyi olduğu söylenemez.
İkinci sorunuza ithafen, evet yapabiliyorsunuz. Hem kurulum sırasında hem kurulumdan sonra istediğiniz modülü ekleyip çıkarmanız mümkün.