Yapacağınız işlem şu:
Eski diski çıkartın ve sadece yeni disk takılı iken sistemi başlatın.
Sistem sorunsuz başlar ise klonlama başarılı şekilde gerçekleşmiş demektir ve eski diski geri takıp biçimlendirebilir/silebilirsiniz.
Çalışmaz ise birşeyleri yanlış yapmış olabilirsiniz.
EK : Farklı boyutlarda olması normal. Klonlama işlemi sırasında.. örneğin Pagefile klona dahil edilmiyor. Yeni disk ile sistem başlatılınca pagefile sıfırdan ve kendiliğinden oluşuyor.
@Alpay Güner