O halde dosyaların kaybolması, güvenlik programlarının kaldırılması veya sürekli olarak sistemin DLL hatası vermesi belirtiler arasında sayılabilir.
Ama bunların hiçbiri kesin sonuç vermez, trojan virüsü kendini belli etmeyebilir de yani. AV ile tarama yapmadığınız sürece emin olamazsınız diye düşünüyorum.