Doğrudan Gnome ana sürümü kullanıyorsanız, masaüstü yönetimi aracı ile ilgili bir sorun olabilir. Eskiden masaüstü yönetimi doğrudan dosya yöneticisi Nautilus tarafından sağlanıyordu. Gnome geliştiricileri Nautilus dosya yöneticisinin bu özelliğini kaldırdıktan sonra, kullanıcılar bu ihtiyacını 3. parti eklentiler ile çözdüler. Bu tür eklentiler bazı dağıtımlarda kurulu ve etkin geliyor olabilir, Ubuntu'da olduğu gibi. Ve bu eklentideki bir hata ya da uyumluluk sorunu sebebiyle Masaüstündeki bir dosyayı, farklı bir dizine taşırken bahsettiğiniz sorun ortaya çıkıyor olabilir.
Farkı anlamak için, dosya yöneticisini açıp masaüstüne gelin, masaüstündeki dosyayı doğrudan dosya yöneticisi ile kopyalamayı ya da taşımayı deneyin. Eğer doğrudan dosya yöneticisi ile bahsettiğiniz donma sorunu yaşanmıyorsa, sorunun kaynağı eklenti olabilir.
Eğer masaüstünü kullanmayı seviyorsanız, Gnome yerine MATE, Xfce ya da Cinnamon masaüstü ortamlarını tercih etmeniz daha uygun olacaktır. Özellikle Xfce ve Cinnamon'un masaüstü yönetimi oldukça başarılıdır.