Genel olarak en büyük sıkıntı depolama amaçlı ikinci bir diski olanların başına geliyor. Örneğin virüslü bir program yada dosya yüklemiş, bu virüs kendini o diske de kopyalıyor. Temiz kurulumda her iki disk de silinmelidir. Daha sonrasında ise temiz kurulum yapılır, biçim ve bölümlendirme kısımından ikinci disk oluşturulur ve C: D: olarak temiz bir şekilde kullanabilirsin.