Eğer OS agnostik olmayan App yazmıyorsan, yazdığın kod Windows'ta da aynı, Linux'ta da, Mac'te de. Algoritma yazıyorsun.
Hele söz konusu web geliştirme olduğunda hiçbir farkı yok. Kullandığın toollar ve onların GUI'leri değişiyor, değişirse o da. Velev ki OS spesifik bir şey yazıyorsun var sayalım, o zamanda kullanacağın API ve libraryler dışında yazacağın kodun mantığı aynı.