Hiçbir sorun olmaz. BIOS üzerinden SSD'yi açılış diski seçerseniz sorun çıkmaz. Bilgisayar açıldıktan sonra dilerseniz HDD'yi USB bellek gibi biçimlendirebilirsiniz veya öylece bırakabilirsiniz. Bilgisayar SSD üzerinden boot edilirse diğer diskin içinde ne olduğu önemsizdir. Ben de tam olarak aynısını daha önce yaptım. Bir süre eski laptop diskini takviye olarak kullandım.
Tekrar edeyim, diğer diski formatlamak gerekli değildir. Sadece SSD üzerinden boot edilmesi yeterlidir. Kritik veri yoksa sonra harddiski dilerseniz formatlayabilirsiniz.