Formattan kasıt Windows yüklemek zaten. Windows yüklediğinde de cihazın FreeDOS falan olmuyor. Windows kurulum ekranında diskinin bütün bölümlerini silip, diskin üzerine tıklayıp, aşağıdan "yeni" seçeneğini seçtiğinde, diskin Windows'a uygun bir şekilde bölümlendiriliyor. Daha sonrasında yapacağın başka bir şey yok disk ile ilgili.
Bu arada
@Fatalis 'nin de dediği gibi, Linux tarafında rufus yok. Bunun için, aynı görevi gören başka bir programa veya hâlihazırda Windows kurulu bir cihaza, rufus programını kullanmak için ihtiyacın var.