Sorun olmaz. Merak etmeyin. İşletim sistemi fark etmez, harddisk sadece verilerinizi depolar.
HDD'yi bağladığın zaman BIOS üzerinden sırayla boot edilecek disklerden mutlaka Windows 10 yüklü diski en başa al, sonra bilgisayarı yeniden başlat ve rahatlıkla kullanabilirsin.