Popup ve uyarıları okumama gibi bir sıkıntımız var bizim. Comodo her şeyi virüs olarak görmüyor, kurulduğunda varsayılan olarak aktif gelen HIPS modülünün ve güvenlik duvarının uyarıları onlar. Varsayılan - safe mod - açıkken Comodo tarafından tanınan ve güvenilir uygulamalara otomatik izin verilirken bilinmeyen uygulamaların internete bağlanması ve bilgisayarınız üzerinde çeşitli işlemleri gerçekleştirebilmesi için sizden izin istenmektedir. Zırt pırt uyarı çıkmaması için HIPS'ı kapatabilirsiniz, nasıl olsa her uyarıya izin ver dediğiniz için o modülün bir anlamı kalmıyor.