Exe dosyasının kaynak kodlarını göremezsin. Eğer söz konusu program açık kaynak ise ve bilinen bir deposu varsa oradan kaynak kodlarına erişebilirsin. Bunun dışında bir hex editörü kullanarak exe dosyasının binary (ikili) modda görüntüleyebilir ve makine kodunu inceleyebilirsin.
Bir exe dosyasının kesin olarak kötü amaçlı kod içerip içermediğini anlamak mümkün değildir. Bunun için uzman olmak gerekir ki kimi zaman uzmanlar bile yanılabilirler. Bunun yerine VirusTotal'de taramak bir fikir verebilir ama o da kesin garanti vermez.
Genel olarak güvenilir programları kullanmak ve onları da resmî ve yasal kanallar üzerinden elde etmek en güvenli yoldur. Korsan ve bilinmeyen sitelerden indirilen ya da birisinin sana attığı bir exe dosyasını çalıştırmak risklidir.