AppImage sıkıştırılmış şekilde tüm bağımlılıklarla beraber programı sunar. Flatpak ise sıkıştırılmış şekilde değildir, her bir bağımlılık ayrı ayrı indirilir kurulum sırasında. Sistem paketleri ile olan dosya boyutu farkı ise bir sistem paketi kurduğun zaman aynı bağımlılıkları tekrar indirmemen. Örneğin a paketi x paketine bağımlı. Sistem paketi kurulumunda x paketi zaten kurulu ise tekrar kurulmaz ama AppImage ve Flatpak'ta x paketi sistemde kurulu olsa bile bir kez daha indirilir.