Ana kart yazılımına bulaşmışsa formata rağmen kalır, ancak bu aşırı düşük bir ihtimaldir, neredeyse %0'a yakın. Bu eskiden (ki o zaman da çok nadirdi) olabiliyordu ama modern BIOS'larda buna karşı daha ciddi önlemler mevcut.
En garantisi bence bir USB kurulum medyası hazırlayıp, Özel kurulumu seçip, tüm diskleri biçimlendirdikten veya sildikten sonra yeni birim yaratıp sıfırdan Windows kurmak. Bunun dışında Windows Ayarları üzerinden yapmanın da yolu var.